Menjadikan PSPD Fakultas Kedokteran UBAYA sebagai Institusi Pendidikan Kedokteran Berstandar Internasional yang inovatif dan unggul dengan:
- Dihasilkannya dokter yang bermutudan memenuhi Standar Kompetensi Dokter Indonesia yang berwawasan kebangsaandan multikultur, dengan keunggulan di bidang ilmu kedokteran herbal berbasis teknologi kedokteran.
- Dikembangkannya penelitian sebagai bentuk pengembangan ilmu pengetahuan dan teknologi di bidang kedokteran, utamanya dalam kedokteran herbal untuk peningkatan kualitas hidup masyarakat sehingga akan menjadi rujukan nasional dan internasional
- Dicapainya pengabdian masyarakat yang dapat mendorong kemandirian dalam bidang kesehatan dan kesejahteraan masyarakat secara berkelanjutan.
- Ditingkatkannya mutu penerapan tata kelola institusi yang baik (good university governance – GUG).